A partir del último ascenso a Tercera se viven los años más felices del club, camiseta man city y también algunos de los más complicados. Muy recordadas son en la localidad las participaciones en Copa del Rey de los años 90, siendo sin duda la más laureada la de 1992-93, en la que se elimina al Toledo en primera ronda, al Valdepeñas en segunda, y se vive el culmen de la sociedad al derribar al Eibar en un partido de vuelta épico en el que se cosecha una derrota por 3-2 en Ipurúa, resultado que hace bueno el 3-1 conseguido en el Municipal.
